Este setor é o responsável pelo intercâmbio das Unidades de Ensino na USP com os Órgãos Federais, no caso a Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior – CAPES e o Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico – CNPq, no que se refere, principalmente, a bolsas de estudo, avaliação dos Programas de Pós-Graduação e Acordos de Cooperação Internacional.