O Programa de Pós Graduação em Engenharia Mecânica (PPGEM) foi criado em 1980 e é formado dos cursos de Mestrado e Doutorado em Engenharia Mecânica. Até 2013 o PPGEM formou 755 Mestres e 284 Doutores.

Trata-se de um programa abrangente com pesquisas nas áreas:

• prospecção de petróleo (estabilidade, manobras e risers);
• ambiental (urbana, emissários e acústica submarina);
• aerospacial (fluido-estrutura e biomédica em voo);
• biomédica (ventrículo artificial, tomografias de impedância elétrica e ultrassom e biorobótica);
• mecânica clássica (massa adicional, massa variável e mecanismos);
• otimização (topológica e aerodinâmica);
• inteligência artificial (controle de eventos, decisão);
• CAD (empacotamento);
• problemas inversos (unicidade/existência e algoritmos);
• energia (exergia e co-geração);
• materiais (tribologia/lubrificantes e comportamento de materiais);
• veículos (impacto e segurança).

O Programa de Pós Graduação em Engenharia Mecânica (PPGEM) é um programa de pós-graduação strictu sensu que atua em conformidade com o Regimento de Pós Graduação da Universidade de São Paulo. O regulamento do programa foi atualizado em 2014 para se harmonizar com  o novo Regimento de Pós-Graduação da USP. A nova estrutura legal favorece a internacionalização, os convênios de dupla-titulação e a mobilidade de estudantes, professores e funcionários.